新成立的青海省獸醫局，為省農牧廳內設正處級行政機構，承擔獸醫行政管理職能，同時，撤銷省農牧廳畜牧獸醫處，保留畜牧處，承擔畜牧行政管理職能。在建立獸醫行政執法機構方面，合并省動物檢疫站、省動物防疫監督管理所，組建青海省動物衛生監督所；各州(地、市)、縣(市、區)畜牧獸醫站，并掛動物衛生監督所牌子，其主要職責是依法實施動物防疫、動物及動物產品檢疫、動物產品安全和獸藥監管等行政執法工作。在建立健全獸醫技術支持機構方面，撤銷青海省畜牧獸醫總站，分別成立青海省畜牧總站和青海省動物疫病預防控制中心。