主要區別有兩點：一是現有涉農補貼大多按照計稅面積發放，與是否種植和種植何種農作物不掛鉤，是普惠制補貼；目標價格補貼要與作物實際種植面積或產量、銷售量掛鉤，多種多補，不種不補。二是現有補貼相對固定，只增不減，年年發補貼；目標價格補貼要與市場價格掛鉤，只有當市場價格低于目標價格時才發補貼；低的越多，補貼越多。