國(guó)家發(fā)改委明確對(duì)東北地區(qū)經(jīng)山海關(guān)站入關(guān)的玉米、大豆等品種收取鐵路建設(shè)基金，而鐵路運(yùn)入大連（供海運(yùn)）的則不實(shí)行，以緩解鐵路入關(guān)運(yùn)輸?shù)膲毫Γl(fā)揮我國(guó)沿海水運(yùn)的潛能。
雖然本次基金的重新收取標(biāo)準(zhǔn)（每噸公里0.012元）比以前確定的征收鐵路基金標(biāo)準(zhǔn)（每噸公里0.0415元）相對(duì)明顯降低，但對(duì)玉米、大豆購(gòu)銷企業(yè)的成本還是構(gòu)成一定影響，企業(yè)采購(gòu)成本增加。如吉林長(zhǎng)春到上海鐵路距離約2350公里左右，恢復(fù)后每噸玉米運(yùn)輸成本約增加28～30元。對(duì)于大豆而言，山東地區(qū)油廠，從哈爾濱到山東濟(jì)南的鐵路里程大約是1600公里，大豆采購(gòu)成本將上漲19.2元/噸。
中國(guó)大豆網(wǎng)一位分析師表示，我國(guó)對(duì)鐵路建設(shè)基金的重新征收很可能導(dǎo)致進(jìn)口大豆數(shù)量增加。征收鐵路建設(shè)基金意味著東北發(fā)往關(guān)內(nèi)的大豆成本將會(huì)上揚(yáng)，在目前整個(gè)市場(chǎng)供大于求的情況下，成本的提高無疑將會(huì)更加重這些油廠的銷售壓力，因此關(guān)內(nèi)的一些油廠采購(gòu)東北大豆的興趣可能會(huì)下降，轉(zhuǎn)而訂購(gòu)更多的進(jìn)口大豆，盡管這次恢復(fù)征收的收取標(biāo)準(zhǔn)并不高。
一些市場(chǎng)人士認(rèn)為，鐵路運(yùn)費(fèi)提升后，在利潤(rùn)縮水的情況下，貿(mào)易商很可能會(huì)改投水路，尋找新的貿(mào)易通道，原來的內(nèi)陸貿(mào)易商會(huì)轉(zhuǎn)做港口貿(mào)易。以吉林長(zhǎng)春—廣州為例，鐵路里程3459公里，入山海關(guān)后里程2313公里,運(yùn)費(fèi)將增加27.756元/噸，與此同時(shí)，由于油價(jià)不斷下調(diào)，海運(yùn)費(fèi)價(jià)格繼續(xù)回落，目前北方港口至南方港口運(yùn)費(fèi)已經(jīng)下調(diào)了20元/噸左右。如果從陸路改走水路，僅運(yùn)費(fèi)一項(xiàng)成本就可節(jié)省近50元/噸。
北京工商大學(xué)教授高揚(yáng)認(rèn)為，恢復(fù)征收鐵路建設(shè)基金可能會(huì)增強(qiáng)大連地區(qū)期貨市場(chǎng)地位。她表示，每年大連—鲅魚圈—錦州港口沿海一線內(nèi)貿(mào)運(yùn)輸量可達(dá)650萬～700萬噸，約占東北玉米內(nèi)貿(mào)數(shù)量的1/4～1/3左右。此外，我國(guó)的外貿(mào)出口玉米幾乎全部通過該地轉(zhuǎn)運(yùn)，自1999年以后隨著玉米外貿(mào)出口量的不斷增加，每年出口數(shù)量在1000萬噸左右。運(yùn)費(fèi)調(diào)整后，海運(yùn)優(yōu)勢(shì)進(jìn)一步加大，一些企業(yè)貿(mào)易流向的部分改變會(huì)增加大連沿海一線流量，而大商所在大連及周邊地區(qū)設(shè)有25家定點(diǎn)交割庫，年度商品交割超過百萬噸，流量的增加將進(jìn)一步促進(jìn)交易所功能的發(fā)揮，期貨市場(chǎng)地位也將得到增強(qiáng)。
鐵路建設(shè)基金是經(jīng)國(guó)家批準(zhǔn)在鐵路貨運(yùn)價(jià)格基礎(chǔ)上收取的專門用于鐵路建設(shè)的專項(xiàng)行業(yè)發(fā)展基金，自1991年至今，鐵路建設(shè)基金累計(jì)收取近4000億元，占同期鐵路基建投資總額的42%。從2002年4月1日至2006年，國(guó)家免征了糧食、棉花類8種貨物品名的鐵路建設(shè)基金；從2003年3月1日起，免征豆粕類貨物鐵路建設(shè)基金至2005年。
