一、定性不定量的檢測原則
    農業部轉基因管理辦公室非正式消息稱，對轉基因產品的鑒定將采取容許量為零的嚴格標準，任何被檢驗出轉基因陽性的大豆、油菜子將用標簽進行標識，轉基因產品安全證書和其它相關的轉基因產品管理條款將適用于這些被標識的產品。
    國內大豆貿易和加工企業認為定性不定量的檢測原則作為轉基因產品的鑒定標準與國際上通行的標準不同，國際上的慣例做法是以百分比含量為基準的。也就是說，只有那些轉基因含量超過規定百分比含量的產品才被標為轉基因產品。農業部“定性不定量”的規定在實際的大豆進口中缺乏可操作性。如果確實按這種零容許量的檢測標準，那么巴西大豆將比較難進口。因為預計巴西20%的大豆為轉基因大豆，種子是從鄰國（阿根廷）走私到巴西的，而巴西政府還沒有正式允許種植轉基因大豆。因此，對巴西的大豆出口商來說，提供申請安全證書所要求的對人類和環境無害的官方批準文件根本無從談起。安全證書申請不到，就意味著無法進口巴西的大豆。國內大豆貿易和加工企業希望農業部考慮企業的意見，改變用零容許量對轉基因產品進行鑒別的定性檢測標準。
    二、關于安全證書的申請
    據悉，農業轉基因管理辦公室已經開始接受境外公司對安全證書的申請，到3月31日截止，6月30日前作出批復。境外公司必須提供進口安全管理辦法中規定的材料，對人類和環境無害的證明應該由境外公司所在國家官方的檢測報告，不能是那些非官方的檢測機構提供的報告。另外，還需要農業部指定的技術檢測機構提供的檢測報告。據悉，到目前為止，農業部尚未指定國內的技術檢測機構。如果一批進口大豆中有不同的基因品種，要分別申請安全證書。
    國內大豆貿易和加工企業對安全證書申請工作的了解已經比細則公布之初有所增加，但這些了解還只停留在紙面上，只有在實際的申請過程中才能知道農業轉基因管理辦公室具體的要求和尺度。所以，國內的大豆貿易企業紛紛通知境外供應商加緊安全證書的申請。
    三、關于大豆產品和小包裝油的標識問題
    農業部轉基因管理辦公室非正式消息稱，3月20日前已經到貨的進口轉基因大豆雖然不受細則的約束，但如果加工生產出來的豆油和豆粕在3月20日以后銷售和流通仍然要按照標識管理辦法進行標識，具體如何標識有關部門尚在研究和考慮；另外，從美國或阿根廷進口轉基因大豆毛油進行加工，如果進口毛油在3月20日后到港，同樣要申請安全證書。
    國內不少油廠認為標識管理辦法的出臺對小包裝油的銷售是個不小的沖擊。因為我國的消費者原來對轉基因問題知之甚少，3月20日以后發現自己每天在吃的豆油、菜子油都標識為轉基因產品，而目前我國還沒有官方的輿論闡明轉基因食品一定是對人類無害的。所以預計不少消費者對貼有轉基因標簽的小包裝油將持謹慎態度，在一段時間內使得小包裝色拉油的需求下降，從而影響了國內的大豆或油菜籽壓榨。如果國家新聞機構配合壓榨廠進行輿論上的引導，對消費者樹立恰當的轉基因食品的消費觀念會有幫助。