美國環境醫學研究會（AAEM）自2009年發表了關于轉基因食品的立場文件4大觀點之后，又提出了轉基因食品的《健康風險指引手冊》，這本手冊指出，一系列的動物研究實驗表明食用"基因食品對健康構成嚴重威脅",并要求暫停轉基因食品。"轉基因食品和對健康的負面影響之間有各種聯系"和"基因改造食物產生嚴重的健康風險在過敏和免疫功能，生殖健康方面的，以及代謝，生理和遺傳健康等方面".美國環境醫學研究會（AAEM）醫生提醒所有疾病患者盡量避免吃用轉基因食品。美國環境醫學研究會（AAEM）關于轉基因食品的立場呼吁：

　　1、關于轉基因食品，立即執行長期的安全測試和轉基因食品標簽制度。

　　2、醫生要教育他們的病人，醫學界和公眾都應該避免轉基因食品。

　　3、醫生要考慮到轉基因食品對病人病情的作用。

　　4、更獨立地進行長期科學研究以積累數據調查轉基因食品對人體健康的作用。

　　美國環境醫學研究會（AAEM）成立于1965年，是一個國際性協會，由關注臨床問題，特別是人類和環境相關問題的醫生和相關專業人員組成。協會旨在增進人類和環境相互作用的知識，尋求可能反映人類健康與自然的整體認識。協會提供這方面的研究和教育科普知識，尤其是由于接觸空氣，食物和水中的化學和生物引起的疾病治療和預防的問題。