發酵床的建設要因地制宜。在東北，要考慮夏季的通風降溫和冬季的防寒和排濕。因此，東北發酵床豬舍應該是封閉式的。豬舍的舉架以發酵床的表面算起，最低不得低于2.5 米，最好達到3米，這樣的空間有利于空氣的快速流動。豬舍的寬度在10 米左右為宜。豬舍的長度可以20～60 米。南窗要盡量的大，這樣才能使豬舍陽光普照，生物發酵床豬舍非常強調豬舍采光的重要性，因為陽光可以使豬感到溫暖，陽光可以使生物發酵菌繁殖得更好，陽光能夠使豬舍的水分迅速的蒸發，可見，在生物發酵床豬舍設計時，豬舍的采光和通風是最重要的，這是不同于常規水泥地面豬舍的最重要的特點。另外，發酵池的四壁，尤其是靠外墻處應當考慮做苯板防寒層，南方不需要這樣做，但是在東北冬季必需要防寒層。