在無抗生素的生產環境下，家禽腸道健康管理不能使用預防性的飼料添加藥物，如抗生素和抗球蟲藥，其重點由對抗腸道微生物群落（菌群），轉變為利用腸道微生物群落（菌群）。這通常是通過使用益生元和益生菌來實現。微生物導致的健康風險包括但不局限于：親代與子代孵化前的分離、全進全出的生產系統、整體清潔和消毒、高采食量、高蛋白質日糧和高存欄密度。通過穩定腸道生態系統，將有可能實現腸道組織的良好發育，從而保障健康的腸道功能。促進菌群的成熟和穩定，對雛雞的初期發育最有效。

　　然而，即使在腸道組織發育良好、腸道功能健康的情況下，腸道菌群的穩定性仍可能因集約化的生產方式而受到風險的威脅，這些問題都需要有針對性地加以解決。應在日糧更換，或者應激導致紊亂并使用了抗菌治療后，再來考慮通過益生素或益生菌來調節腸道菌群狀態。

　　腸道生態

　　早期腸道發育的重要性怎么強調也不為過。

　　消化和吸收效率與腸道表面積及上皮層的發育狀況直接相關。上皮細胞的微纖維及細胞間的緊密接合，構成了腸道細胞骨架，從而使腸道組織與復雜的腸道微環境隔離。上皮細胞表面由眾多絨毛和微絨毛覆蓋，使其面積增加了約600倍。

　　這也促進了機體內水分的循環利用和營養物質的不斷吸收，同時防止微生物及其有毒代謝物對機體的侵害。

　　復雜的和諧

　　腸道菌群和宿主之間的關系既復雜又和諧，這對于腸道的消化和吸收功能至關重要。這種關系受到任何破壞，都會刺激宿主產生保護性反應，包括引發炎癥和胃腸道疾病。

　　腸道菌群成分的消極變化與腸道功能惡化有關，這可以通過飼料轉化率來評估。家禽行業通常所謂的菌群失調癥，在歐盟禁止向飼料中添加抗生素后變得很常見。

　　盡管家禽生產系統都是全進全出模式，但從腸道菌群的角度來看，它們是連續的。某些得以存活的腸道菌群成員，由一個周期轉移到下一個周期，成為下一批次家禽腸道菌群的儲備種子。宿主菌群的改變，可能要歷經多個生長周期。

　　即使是腸道菌群成分的微小變化，都會影響長期生產力，因此需要對此加以管理。營養吸收的效率取決于一個良好腸腔環境的及早建立和維持。

　　在禁止藥物添加的生產系統中，重點由對抗有害微生物轉向培育有益微生物。其中，最簡單的方式包括：

　　向腸道播種有益菌

　　向有益微生物提供營養，促使其快速主導腸道環境

　　消除有害微生物

　　向腸道播種有益微生物首先在腸道定植的微生物決定了復雜菌群所必需的微環境，從而決定了頂級菌群的組成。由于菌種能夠調節腸道上皮細胞的基因表達，為穩定良好的頂級菌群創造有利條件，因此腸道的定植應是任何腸道健康措施的起點。

　　最先進入雞苗腸道的微生物源自親代家禽，因此腸道健康的管理應從親代菌群水平的控制開始。腸道微生物的垂直傳播可通過雞蛋攜帶，或者也可能是蛋殼污染的結果。

　　在清潔的人工孵化環境中，即使是低劑量的有益菌，也可以提高對病原菌定植的抵抗能力。因此，在發育早期就向家禽腸道人工播種有益菌，非常有效。培育有益微生物除了向腸道播種有益菌，提高有益菌的增殖能力、競爭能力和定植能力也非常重要。

　　弱有機酸可以用來改變腸道菌群的群落結構。作為弱質子供體，弱有機酸能夠不受前胃和砂囊失活的影響，而它們存在于小腸，則會改變其微生物群落的構成。增強耐酸性微生物如乳酸桿菌的競爭優勢，降低非耐受性微生物如梭狀芽胞桿菌的競爭能力，這些措施使引導菌群發展成為可能。此類微生物調節方法將產生短期和長期影響。

　　消除有害微生物隨著定植的進行，微生物彼此聯接并附著于上皮細胞，由此在腸道表面形成一個牢固的黏附墊，病原體因此無法侵入上皮表面。

　　微生物附著于宿主細胞產物（粘液）和腸道上表皮的特定微生物對接點上，這對于腸道定植和感染來說是極其關鍵的第一步。由于某些腸道病原體識別并附著于特定的腸道上皮糖蛋白上，模仿這些對接點的人工產品能有效防止這種附著。

　　病原體引發的腸道內層炎癥能刺激黏液分泌，增強對位細胞滲透性，并加快飼料的通過速度，之后就會自我延續。

　　對抗球蟲病目前，對于禁止藥物添加的家禽生產系統而言，接種疫苗是對抗球蟲病風險的唯一途徑。

　　美國的球蟲疫苗沒有稀釋，整個免疫過程采取控制曝光法。降低控制曝光法副作用的唯一途徑就是控制劑量。劑量太高會導致過度反應和早期（1~2周）腸炎。劑量太低則不能充分反應。臨床球蟲病潛伏期一般為3~4周。

　　簡單策略

　　商業運作環境下的腸道健康改善策略需要考慮成本、可持續性、農場實際情況和整體性。干預/產品選擇需要兼顧科學性和實用性，并且要明確達成目標。如今，在使用替代產品培育和穩定有益菌群方面的努力顯示出良好的前景。雖然干預方法有多種，但其中三種最具希望：通過向雞苗腸道播種有益微生物，使用適當的有機酸培育有益菌，使用1型菌毛阻滯劑消除有害菌，將能夠提高無抗生素環境下的生產性能。