微生物棉餅脫毒劑是2001年2月獲得國家發明專利的一種高科技的飼料發酵劑，又稱纖維素酶制劑。它具有非常高的利用價值，一方面可將它用于棉餅脫毒發酵制成無毒棉餅飼料；另一方面可在秸稈飼料發酵中廣泛應用，它能快速將秸稈中的纖維素、半纖維素分解轉化成有價值的菌體蛋白，從而大幅度提高飼料的粗蛋白含量，是秸稈飼料生產技術上的根本性突破。下面介紹其三種用法：

一、制作無毒棉餅高蛋白飼料棉餅中富含植物性蛋白，是禽畜食用的好飼料，但因棉餅中含有毒性物質——棉酚，而棉酚的去除又非常困難，因此大量棉餅沒有用在飼料上，造成很大的浪費。用棉餅脫毒劑可以輕易地解決這個難題。其操作是：按棉餅重的50％加清水拌濕，再加入少量的玉米面、麥麩作為發酵助劑，再按餅重的0．1％加入微生物棉餅脫毒劑，四者充分拌勻后放入盆、缸或在水泥地上堆積發酵脫毒，經3－5天后，棉餅上長出少許灰白色菌絲，并發出甜、香、酸、酒味，此時棉餅脫毒結束，一種良好的無毒棉餅飼料就制成了。

二、制作高蛋白青貯飼料在農作物秸稈收獲時，將秸稈鍘碎，按秸稈重量的0．05％加入棉餅脫毒劑，放入青貯器內（如水泥池、土窖或塑料袋等）進行發酵，和傳統青貯一樣，層層壓實，最后封嚴，經3周左右，青貯飼料具有甜、香、酸、酒味時即可飼喂家畜。因脫毒劑具有防腐功能，青貯飼料可貯存3－5年（最好一年喂完）。以玉米秸稈為例，青貯前含粗纖維29．3％，粗蛋白為5．7％，青貯后粗纖維降為28．4％，粗蛋白上升為12．9％。

三、制作干秸稈高蛋白發酵飼料將干秸稈鍘碎，放入清水中漂洗干凈，撈出后在水泥地上瀝去多余的水分（約1－2小時），水泥地進行消毒后，把秸稈鋪成長方形的堆，每層厚15厘米左右，在堆料上撒一層發酵劑，并依前法一層秸稈一層發酵劑，其分三層，總計厚度45厘米，堆料結束后，蓋上纖維袋保溫，經3－5天發酵（冬春需4－5天），料面上長出灰白色菌絲，料發出甜、香、酸、酒味時即可飼喂牛、羊等。發酵料需經2天喂完，不宜久貯，以免變質。