內蒙古自治區水產品質量檢測中心于2006年首次通過自治區級實驗室資質認定評審。三年來，本中心在漁業水質環境監測，水產品質量安全檢測，漁業病害監測，水生動物防疫檢疫，水生生物鑒定分析等方面做了大量的工作。特別是2008年在“三聚氰胺事件”中，為伊利、蒙牛兩大乳品企業完成了3000多個批次原乳及乳制品中三聚氰胺項目的檢測，為兩大企業解決了燃眉之急，同時也提高了檢測人員的業務能力。先后被農業部農產品質量安全中心指定為“無公害水產品定點檢測機構”及“全國農產品地理標志產品品質鑒定定點檢測機構”，2009年內蒙古漁業環境檢測保護站由丙級升為乙級。根據業務需要，本中心在此次復查評審中，在原有檢測基礎上，增加了無公害畜、禽、蛋及生鮮乳的檢測，擴大了本中心的檢測范圍和知名度，為進一步提高我區農畜產品質量安全多貢獻一份力量。