受災地區各級漁業主管部門積極開展抗洪救災工作，成立抗洪救災領導小組，緊急部署抗洪救災工作，根據災情緊急啟動應急預案，實行24小時應急值守，認真做好汛情和災情調度，加強災害損失統計工作。各級水產技術推廣和科研單位人員分赴一線、進場入戶查看災情，開展技術指導服務。福建和廣西分別下發了《水產養殖洪災后恢復生產技術措施要點》和《“短、平、快”漁業養殖項目簡介》，幫助養殖戶提高自救能力。江西省以政府采購形式向全省非災區購買1億尾夏花魚種等漁需物資，幫助受災漁民補救損失。為防止災后疫情發生，福建等省加強疫情防控知識的宣傳和服務工作，指導漁民進行病害預防與治療，并加強水質和疫病監測，同時組織養殖戶及時清理死魚并作無害化處理，避免污染水質，防止水生動物疫情發生。

    鑒于當前強降雨天氣還在繼續，不確定因素較多，農業部將繼續指導各地組織開展抗洪救災及災后復產準備工作。一是要求未受災地區密切與氣象部門的聯系，及時排除隱患，提前做好防災準備工作。二是指導受災地區做好災后復產的技術與物資準備，幫助制訂災后復產計劃，加強水質監測和調控，協調做好苗種調劑，因地制宜開展一些短、平、快的項目，爭取獲得一些經濟收入，同時協助做好受災漁民的思想工作，維護漁區社會的穩定。三是加強科技服務，因地制宜指導養殖場（戶）解決恢復生產所面臨的技術難題，并組織專家赴災區協助當地政府和漁業主管部門開展漁民培訓工作，提高漁民生產自救能力。