禽流感是一種由甲型流感病毒的一種亞型（也稱禽流感病毒）引起的傳染性疾病，被國際獸疫局定為甲類傳染病。通常只感染鳥類，很少情況會感染豬。禽流感病毒高度針對特定物種，但在罕有情況下會跨越物種間障礙感染人。自從1997年在香港發現人類也會感染禽流感之后，此病引起全世界衛生組織的高度關注。其后，本病一直在亞洲區零星爆發，但在2003年12月開始，禽流感在東亞多國──主要在越南、韓國、泰國──嚴重爆發，并造成越南多名病人喪生。直到2005年中，該病不但未有平息的跡象，而且還不斷擴散，遠至東歐多個國家。

    中國科學院動物研究所何宏軒研究組通過對215個人源的H5N1病毒株和5885個禽源的H5N1病毒株的HA序列進行分析，并結合地理信息學數據和鳥類遷徙動態數據，綜合分析認為：（1）全球人源H5N1病毒株分為4個大分支，即Southern China cluster（華南分支，CN）、Indonesia cluster（印度尼西亞分支，ID）、Indo-China cluster（印支分支，IC)以及Middle Asia-north Africa cluster（中亞-北非分支，MN）。進一步的糖基化位點分析表明，這四大分支屬于3大病毒類型，即廣東196型或原始型（the GD196 type or original type），過渡性（the Transitional type）和印度尼西亞型（the Indonesia type）。這些結果表明，全球人源H5N1病毒株根據地域不同存在不同的進化亞型，而且在防控上也要選用同地域毒株制備疫苗。（2）在進化分支上，人源H5N1病毒株分散在禽源的H5N1病毒株中，這表明人源H5N1病毒株來源于禽源H5N1病毒株，不同地域病毒傳播是通過鳥類來傳播的，而人與人之間或人與鳥之間單項不能直接傳播。（3）從病毒溯源上來看，本研究的結果推測華南很可能多個病毒支系的共同來源。綜上所述，我們了解到，人感染H5N1禽流感病毒多是接觸了感染H5N1病毒的病禽而感染，從發生的人病例的事實來看，符合這一說法。

    該研究提出的對全球流感毒株的分型和分類的方法尚屬首次，對于未來研究禽流感的進化具有重要的參考價值。