菌糠是食用菌采摘后的基質肥料。栽培食用菌的原料多為纖維素含量較高的物質，而食用菌對纖維素、木質素等具有較強的分解轉化能力。隨著食用菌的反復生長與采集，使其原料的營養成分發生相應的變化，其中粗纖維含量有較大幅度的降低，而粗蛋白含量明顯提高(殘留的菌體蛋白是其主要成分); 由于菌糠中含有較多的菌絲體，散發濃郁的蘑菇芳香氣味，適口性好，家畜喜食。菌糠發酵后，其營養價值會進一步發生改變，營養更豐富，氣味更芳香，適口性更好，是優質綠色飼料。
(一)菌糠及菌糠發酵飼料的營養
據測定，醋糟菌糠粗纖維含量為30%，粗蛋白質9.85%，灰分16.35%、鈣1.69%、磷0.49%、水分8.81%。棉籽殼菌糠粗纖維含量為26%，粗蛋白質10.22%，灰分6.38%、鈣1%、磷0.62%、水分8.73%。經發酵處理后，醋糟菌糠的粗纖維下降至5.07%，粗蛋白質提高到24.94%，粗脂肪1.52%、灰分13.04%、鈣1.50%、磷0.83%，各種氨基酸含量總和16.61%。發酵菌糠適口性好，營養豐富，是畜禽的優質飼料。
(二)發酵方法
1.加曲發酵: 將菌糠粉料(菌糠料曬干后粉碎)70%、麩皮10%、米糠15%、酒曲粉5%(或適量酵母片)，摻水適量，拌勻后入窖(池、缸)密閉發酵48～72小時即可。
2.真空發酵：先制做長9.42米、寬2.6米的矩形鋼筋網，將其兩端用螺栓對接起來，形成直徑3米、高2.6米的圓筒。鋼筋網內壁襯塑料薄膜，填滿菌糠粉料，筒的兩端用塑料薄膜覆蓋，不要漏氣。其中一端留一抽氣孔，每天用真空泵抽氣3次，連續抽4天后，密閉自然發酵。發酵菌糠料的含水量控制在50%。冬季發酵60～90天，夏季發酵30天。
(三)菌糠發酵飼料的特點
菌糠發酵飼料是環保型變廢為寶的飼料新產品，富含蛋白質、氨基酸、鈣、磷等礦物質，可作為基礎飼料原料，添加適當的輔料進行營養平衡，用于配置不同用途的功能性飼料。也可替代部分魚粉、豆餅等精料以降低成本。由于菌糠發酵飼料中含有酵母菌體及其代謝產物，不僅適口性好，而且能促進動物腸道多種有益菌的繁殖，抑制病原菌，提高免疫功能；并能刺激動物分泌各種消化酶，促進動物的食欲，提高消化吸收率，從而促進動物的生長發育。
(四)飼喂方法
　　1.配制豬用復合飼料: 取發酵好的菌糠發酵料，以10%～20%的比例添加到育肥豬混合飼料中飼喂。或取菌糠發酵料20%，加玉米粉30%、米糠20.5%、紅薯干10%、貝殼3%、稻谷8%、魚粉3%、菜餅粉2%、豆餅粉3%、食鹽0.5%混合后飼喂。
　　2.配制牛、羊復合飼料: 取菌糠發酵飼料以25%～40%的比例添加到牛、羊日糧中。反芻家畜對粗纖維消化能力強，也可用未經發酵的菌糠原料經曬干粉碎后直接飼喂。按15%的用量加入奶牛飼料中，按15%～30%的比例加入羊日糧中，均能收到良好的效果。
　　注意在飼用菌糠發酵飼料時要現喂現取，并應從一個方位逐漸取用，取后要蓋嚴，防止雜菌侵入發生腐敗。(