微生物飼料適用于大部分畜禽。主要作用機理是：有選擇地將一種或多種益生微生物菌群制品摻入飼料和飲水中，使其與腸道內有益菌形成優勢種群，抑制和消滅致病菌群，同時分泌與合成大量氨基酸、維生素、消化酶類、促生長因子等生物活性物質，且能提高飼料轉化率，產生免疫、營養、生長刺激等多種作用，達到促進生長和繁殖、防治腸胃疾病、提高成活率、降低成本、消除糞便惡臭、凈化環境的效果。 微生物飼料在養殖上的應用主要有以下兩種形式： （一）生產優質青、黃貯飼料 青綠或干黃的農作物秸稈，營養成分低，粗纖維含量高，適口性和利用率差。但是通過制成微生物飼料，就具有了以上所述特色的青貯和黃貯飼料，微生物飼料的原料廣泛、數量巨大、生產簡單、經濟高效、可以長期保存、便于貯存運輸，且不受自然災害、火災的影響，所以，深受廣大養殖戶的歡迎。 微生物飼料是把生物制品均勻噴灑在經過拉絲或粉碎的原料上，經過3～10天的發酵而成。其主要的生產形式是窖式發酵生產。 (二)生產微生物全價粉狀和顆料飼料 主要成分是草粉、能量原料、蛋白原料，以及相應的維生素、微量元素、礦物質等原料組成。其中草粉比例根據不同畜禽飼喂對象可達50%～80%。是將粉碎的原料在特制的密封包裝袋內發酵，使之成為含有大量菌體蛋白的微生物飼料。并可經過干燥制粒，規模生產，成為長期大量貯存，遠距離運輸的商品。