以乳酸菌為主的微生態活菌制劑具備與飼用抗生素相似的促生長功效，但與飼用抗生素的作用原理卻完全不同：飼用抗生素毫無選擇地殺死微生物（無論有益菌還是有害菌），副作用大；而微生態活菌制劑則通過促進腸道有益菌的生長競爭性抑制病原菌，進而激發動物本質的生長性能。因此微生態活菌制劑具有無毒副作用、無殘留、無抗藥性和不污染環境且成本低的優勢，是飼用抗生素的理想替代者。
一、微生態活菌制劑在動物養殖中扮演的角色
在動物養殖，微生態活菌制劑中起最關鍵作用的是乳酸菌，其次是枯草芽孢桿菌。
①主角：乳酸菌
乳酸菌在下消化道起作用，一方面分泌產生乳酸、過氧化氫、抑菌素，抑制病原菌的滋生，達到防治疾病的功效；另一方面，乳酸菌在腸道內壁定植，促進小腸絨毛生長，增加腸壁內表面積，利于營養物質的吸收；乳酸菌還能夠激活動物機體免疫器官，提高免疫力。
②配角：芽孢桿菌
枯草芽孢桿菌主要在上消化道萌發，一方面分泌消化酶，協助消化飼料；另一方面作為好氧菌，持續耗氧，為下消化道的乳酸菌等厭氧菌創造良好的厭氧環境，間接增強乳酸菌促生長功效的發揮。
二、微生態活菌制劑---亞芯飼用益生菌的設計考量
①乳酸菌
乳酸菌在飼用益生菌中起最關鍵最直接的作用，所以首先考量乳酸菌。乳酸菌是動物腸道自身具有的一種十分重要的益生菌，然而其種群數量常常受到外界因素影響而減少。因此可以通過外援補充乳酸菌，以維護動物腸道內乳酸菌占優勢的菌群平衡。
②枯草芽孢桿菌
枯草芽孢桿菌本身不是動物體內的微生物，但由于它具有分泌消化酶和持續耗氧為乳酸菌生存創造厭氧環境的特點，因此常常作為乳酸菌的輔助菌種。
③益生元
寡糖類益生元，這類物質不能被動物機體吸收，但可作為益生菌的營養物質，促進乳酸菌等益生菌的生長繁殖，提高飼用益生菌的效價。
④代謝產物
乳酸菌經發酵培養后除去菌體后的上清液，內含乳酸菌分泌的豐富代謝產物，如乳酸、抑菌素等，具有優良的抑制、殺滅有害菌的能力。
